（二）監察科。負責中心內部資金稽核和內部審計；負責黨風廉政建設和反腐敗工作；負責重要文件、會議決定事項和領導交辦工作的督辦工作；負責中心績效考核工作；負責信訪以及政（行）風、網絡問政、12329服務熱線的咨詢投訴處理工作。

（三）計劃財務科。負責制定公積金等各項資金管理的年度計劃；負責公積金等各項業務和資金的財務管理和會計核算；負責公積金投資運作管理和公積金增值收益管理；負責對會計憑證、有價證券的保管工作；配合審計機關及有關上級單位對中心進行審計監督。

（四）使用管理科。負責提出和制定年度公積金使用發展規劃和目標；負責起草本市公積金提取、貸款業務政策調整的文件及方案；負責對公積金提取、貸款業務的監督管理和檔案保管。

（五）歸集管理科。負責提出和制定年度公積金歸集計劃；負責起草本市住房公積金歸集業務的政策調整方案；負責對公積金歸集業務的監督管理；負責落實擴大繳存覆蓋面、保障職工利益的催繳、督繳等執法工作。

（六）信息管理科。負責公積金信息系統硬件及軟件的維護和管理，保障系統穩定運行；負責公積金信息系統有關數據、設備配置的備份和管理，保障信息系統數據安全；負責編寫運行分析報告；負責公積金政策宣傳，政務信息報送工作。

各管理部。中心下設市直管理部、宿城管理部、宿豫管理部、沭陽管理部、泗陽管理部、泗洪管理部等6個管理部，具體承擔轄區內住房公積金管理具體任務和市中心交辦的其他工作。